Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Uimc1Q5U5Q9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uimc1Q5U5Q9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Uimc1Q5U5Q9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Uimc1Q5U5Q9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Uimc1Q5U5Q9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Uimc1Q5U5Q9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Uimc1Q5U5Q9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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Uimc1Q5U5Q9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Uimc1Q5U5Q9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uimc1Q5U5Q9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Uimc1Q5U5Q9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uimc1Q5U5Q9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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