Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc5a6Q5U4D8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms