Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubr3Q5U430 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubr3Q5U430 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubr3Q5U430 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubr3Q5U430 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubr3Q5U430 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubr3Q5U430 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubr3Q5U430 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr3Q5U430 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr3Q5U430 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr3Q5U430 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubr3Q5U430 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms