Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NotoQ5TIS6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms