Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brip1Q5SXJ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brip1Q5SXJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brip1Q5SXJ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms