Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tsr1Q5SWD9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tsr1Q5SWD9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms