Protein–RNA interactions for Protein: Q5SU73

Coil, Coilin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoilQ5SU73 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CoilQ5SU73 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CoilQ5SU73 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CoilQ5SU73 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms