Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Utp18Q5SSI6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms