Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r223Q5SSA0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r223Q5SSA0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms