Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf215Q5SPX3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf215Q5SPX3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf215Q5SPX3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf215Q5SPX3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf215Q5SPX3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf215Q5SPX3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms