Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d4Q5RJF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms