Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf1Q5ND28 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf1Q5ND28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf1Q5ND28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms