Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsrp1Q5NCR9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsrp1Q5NCR9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsrp1Q5NCR9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsrp1Q5NCR9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsrp1Q5NCR9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsrp1Q5NCR9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsrp1Q5NCR9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms