Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Trim41Q5NCC3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Trim41Q5NCC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Trim41Q5NCC3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Trim41Q5NCC3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Trim41Q5NCC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Trim41Q5NCC3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trim41Q5NCC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Trim41Q5NCC3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms