Protein–RNA interactions for Protein: Q5G865

Defa24, Alpha-defensin 24, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa24Q5G865 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa24Q5G865 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa24Q5G865 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms