Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ecm2Q5FW85 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ecm2Q5FW85 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms