Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm3Q5F4S9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpm3Q5F4S9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpm3Q5F4S9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpm3Q5F4S9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms