Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndufaf2Q59J78 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndufaf2Q59J78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms