Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srrm1Q52KI8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srrm1Q52KI8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms