Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnl1Q52KE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnl1Q52KE7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnl1Q52KE7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms