Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Opa3Q505D7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Opa3Q505D7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms