Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc84Q4VA36 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc84Q4VA36 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc84Q4VA36 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms