Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Khdc1cQ4KL78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Khdc1cQ4KL78 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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