Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx49Q4FZF3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx49Q4FZF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx49Q4FZF3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms