Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Syne3Q4FZC9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syne3Q4FZC9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms