Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Shank3Q4ACU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Shank3Q4ACU6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Shank3Q4ACU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shank3Q4ACU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms