Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apobec4Q497M3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apobec4Q497M3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apobec4Q497M3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms