Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc110Q3V125 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc110Q3V125 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc110Q3V125 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms