Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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