Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ldlrad2Q3V0V0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldlrad2Q3V0V0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms