Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp48Q3V0C5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp48Q3V0C5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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