Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SvipQ3UZP4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SvipQ3UZP4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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