Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc55Q3UY51 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc55Q3UY51 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc55Q3UY51 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms