Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWR2

Khdc1a, KH homology domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1aQ3UWR2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1aQ3UWR2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1aQ3UWR2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Khdc1aQ3UWR2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms