Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3UST5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3UST5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3UST5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3UST5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3UST5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3UST5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3UST5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3UST5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3UST5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3UST5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3UST5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3UST5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3UST5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms