Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
B3gnt6Q3USF0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
B3gnt6Q3USF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3gnt6Q3USF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms