Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm28047Q3US59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28047Q3US59 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28047Q3US59 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms