Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mindy4Q3UQI9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mindy4Q3UQI9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mindy4Q3UQI9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms