Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Elf3Q3UPW2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Elf3Q3UPW2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Elf3Q3UPW2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms