Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrc1Q3UPH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms