Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlrc4Q3UP44 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlrc4Q3UP44 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms