Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem253Q3UNB8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem253Q3UNB8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms