Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cln5Q3UMW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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