Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnep1r1Q3UJ81 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnep1r1Q3UJ81 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms