Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arfgef3Q3UGY8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfgef3Q3UGY8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms