Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm21748Q3UE70 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm21748Q3UE70 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm21748Q3UE70 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21748Q3UE70 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm21748Q3UE70 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm21748Q3UE70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm21748Q3UE70 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm21748Q3UE70 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm21748Q3UE70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm21748Q3UE70 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm21748Q3UE70 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21748Q3UE70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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