Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Yipf3Q3UDR8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Yipf3Q3UDR8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Yipf3Q3UDR8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms