Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U7U4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U7U4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms