Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U6N9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U6N9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U6N9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms