Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U595 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U595 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U595 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U595 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U595 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U595 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U595 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U595 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U595 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U595 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U595 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U595 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U595 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U595 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U595 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U595 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U595 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U595 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U595 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U595 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U595 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms